justificação do valor científico
Em pleno Planalto da Achada das Furnas, uma zona de vulcanismo fissural basáltico localizada entre os vulcões do Fogo e das Furnas, existe uma cratera de explosão hidromagmática (maar), que integra o sistema de fracturas activo (com orientação Noroeste-Sudeste) designado de Zona de Fractura do Congro, a mais importante zona sismogénica dos Açores. A base da referida depressão encontra-se preenchida pelas lagoas do Congro e dos Nenúfares.
Estas lagoas ocupam uma cratera de explosão do tipo maar, formada há cerca de 3.900 anos, com cerca de 500 metros de diâmetro e paredes fortemente entalhadas em basaltos e traquitos. Os bordos desta depressão apresentam-se sobretudo sob a forma de escarpas rochosas muito íngremes, atingindo desníveis superiores a 120 metros do lado NE.
Devido à sua génese, a cratera e a Lagoa do Congro apresentam características que as distinguem da maioria das lagoas da Ilha de S. Miguel: a sua principal característica é a de, em vez de ocupar o topo de um cone vulcânico mais ou menos bem definido, está fortemente encaixada na região circundante, relativamente plana.
(ZBYSZEWSKI ET AL., 1958, CONSTÂNCIA ET AL., 1997, FRANÇA ET AL., 2003, LIMA, 2007)
Outros valores e sua justificação
Possui um elevado valor estético/paisagístico e constitui local de interesse educativo e turístico, sobretudo em termos de turismo de natureza (e.g. percursos pedestres).
Toda a depressão é preenchida por uma mata ajardinada que rodeia as duas lagoas, foi plantada por José do Canto (Século XIX) e enquadra-se na rota dos jardins da autoria do ilustre micaelense.